FLORON beheert samen met het Nationaal Herbarium Nederland (NHN) de landelijke floradatabank FlorBase. Deze databank bevat plantenwaarnemingen vanaf 1975 op het schaalniveau van 1x1 kilometer. Het gaat in belangrijke mate om de waarnemingen die de vrijwilligers binnen de FLORON-projecten hebben verzameld, maar ook om gegevens van professionele organisaties, zoals provincies, terreinbeheerders en onderzoeksinstituten. FlorBase bevat inmiddels ruim 10 miljoen waarnemingen uit de periode 1975-2005. Het is daarmee het meest complete bestand van verspreidingsgegevens van de Nederlandse wilde flora.
Jaarlijks worden nieuwe gegevens aan de databank toegevoegd. Met de gerichte inventarisaties volgens het Witte Gebieden Plan van FLORON komen veel van de recente gegevens van kilometerhokken die eerder niet zijn onderzocht. De landelijke dekking van FlorBase neemt daardoor steeds verder toe.